این مسجد تاریخی با همکاری سازمان عمران و بازآفرینی شهرداری خوی، هیئت امنای مسجد و تحت نظارت کارشناسان میراث فرهنگی، صنایع‌دستی و گردشگری بازسازی شده است.

همزمان با اجرای پروژه پیاده‌راه هسته مرکزی شهر خوی، جداره‌سازی و احیای بافت‌های تاریخی نیز در دستور کار قرار گرفته و مسجد سلمان‌خان، مسجد شیخ و کاروانسرای خان به عنوان سه اولویت اصلی، یکی پس از دیگری مرمت و احیا می‌شوند.

حجت‌الاسلام حجت قاسم‌خانی، امام جمعه شهرستان خوی در آئین افتتاح این مسجد که به مناسبت دهه کرامت انجام شد با تأکید بر اهمیت بازسازی اماکن مذهبی و تاریخی گفت: مساجد، علاوه بر کارکرد عبادی، نماد هویت تاریخی، فرهنگی و دینی شهر ما هستند و احیای آنها، تقویت پیوند نسل امروز با گذشته پرافتخار این دیار است.

مسجد سلمان‌خان از بناهای تاریخی دوره قاجار به شمار می‌رود و پس از سال‌ها فرسایش، اکنون با حفظ اصالت معماری سنتی، کارکرد عبادی خود را از سر گرفته است.